ニュース2017-2021

八木清 専任研究員らの共同研究成果がNat. Commun.誌に掲載されました。

11/18-19にオンラインワークショップ“Symposium on Computer Simulations and Cryo-ET/EM of Complex Biomolecular Systems”を開催します 詳細・参加登録はこちら

GENESIS1.7.0が公開されました! 詳細はこちら

小林千草 技師らによるカルシウムイオン輸送の分子機構に関する研究成果がPNAS誌に掲載されました。研究成果のプレスリリース

Haeri Im 特別研究員が着任しました。

GENESIS 2.0beta3とGENESIS1.6.1が公開されました! 詳細はこちら

八木清 上級研究員らによる非調和振動計算法に関する研究成果がJ. Chem. Theory Comput.誌に掲載されました。

Jaewoon Jung 専任技師らによる分子動力学計算手法の最適化に関する研究成果がJ. Chem. Theory Comput.誌に掲載されました。

分子混雑環境での酵素とその阻害剤の結合過程に関する研究成果のプレスリリースを行いました。詳細はこちら

Yaokun Lei 特別研究員が着任しました。

住谷 陽輔 基礎科学特別研究員が移動しました。

森 貴治 専任研究員らのクライオ電子顕微鏡構造フィッティングに関する研究成果がJ. Chem. Inf. Model.誌にAcceptされました。

笠原 健人 研究員らの混雑環境でのキナーゼ阻害に関する研究成果がNat. Commun.誌にAcceptされました。

李 秀英 研究員らの環化付加反応酵素に関する共同研究成果がAngew. Chem. Int. Ed.誌にAcceptされました。

EU-ASEAN High-Performance Computing (HPC) Virtual School 2021が7月5-9日にオンライン開催されます。杉田 有治 主任研究員、小林 千草 技師が3日目に講演します。詳細はこちら

信夫 愛 研究員らの粗視化モデルに関する研究成果がJ. Chem. Inf. Model.誌にAcceptされました。

八木 清 専任研究員らの酵素反応経路に関する研究成果がJ. Phys. Chem. B誌にAcceptされました。

本橋 昌大 研修生が研究室に加わりました。

Weitong Ren特別研究員らによるRibose-binding Proteinのマルチスケール分子動力学計算に関する研究成果がJ. Phys. Chem. B誌に掲載されました。

GENESIS講習会が筑波大学（主催）とRIST（共催）によりオンラインで開催されました。詳細はこちら

森 貴治 専任研究員らによるSARS-CoV-2 Spike Proteinに関する研究成果がBiophysical J.誌にAcceptされました。

Hisham M. Dokainish 特別研究員らによる蛋白質ドメイン運動の計算手法に関する研究成果がInt. J. Mol. Sci.誌に掲載されました。

GENESIS 1.6.0が公開されました! 詳細はこちら

Jaewoon Jung 専任技師らによる分子動力学計算手法に関する研究成果がJ. Chem. Phys.誌に掲載されました。

Jaewoon Jung 専任技師らによるGENESISの「富岳」での高速化の研究成果がJ. Comp. Chem.誌に掲載されました。

GENESIS 2.0betaが公開されました! 詳細はこちら

CHARMM-GUI free energy calculatorに関する共同研究の論文がJ. Chem. Theory Comp.誌に掲載されました。

Atg9に関する共同研究の論文がNature Str. Mol. Biol.誌に掲載されました。

GENESIS 1.5.1が公開されました! 詳細はこちら

gREST+FEPを用いた蛋白質の基質認識に関する論文がJ. Chem. Inf. Model.誌に掲載されました。

粗視化分子動力学計算手法に関する論文がJ. Chem. Phys.誌に掲載されました。

糖鎖の分子動力学計算に関する総説がTrends in Glycosci. Glycotech.誌に掲載されました。

GENESIS 1.5.0が公開されました! 詳細はこちら

松岳 大輔 特別研究員が移動しました。

天然変性蛋白質に関する共同研究の論文がNature Chem. Biol.誌に掲載されました。

大出 真央 基礎科学特別研究員が着任しました。

住谷 陽輔 博士のポジションが特別研究員から基礎科学特別研究員に変わりました。

Heme ABC transporterに関する研究がJ. Phys. Chem. Lett.誌に掲載されました。

データ同化に関する総説がCurr. Opin. Struct. Biol.誌に掲載されました。

松岳 大輔 特別研究員らによる論文がJ. Comput. Chem. 誌に掲載されました。

Donatas Surblys 特別研究員らによる論文がJ. Membrane Science誌に掲載されました。

伊東 真吾 特別研究員が着任しました。

森 貴治 専任研究員らによるImplicit Micelle Modelに関する論文がJ. Chem. Theory Comput.誌に掲載されました。

GENESIS 1.4.0を公開しました！ 詳細はこちら

住谷 陽輔 特別研究員が着任しました。

シンポジウムのお知らせ：第57回日本生物物理学会年会「ゲノム機能発現の統合的理解に向けた多角的アプローチ」2019年9月24日（宮崎）（詳細はこちら）

セミナーのお知らせ：Prof. Chen Song (Peking University) 2019年8月27日（和光キャンパス）

新津 藍 基礎科学特別研究員らによる論文がJ. Chem. Inf. Model.誌に掲載されました。

細胞環境下でのシミュレーションに関する総説がAnnu. Rev. Cell. Dev. Biol.誌に掲載されました。

セミナーのお知らせ：Prof. Ove Christiansen (Aarhus University), 木原 大亮 教授 (Purdue University) 2019年7月8日（和光キャンパス）

Alexander T. Hino 国際プログラム・アソシエイト が研究室に加わりました。

セミナーのお知らせ：塩崎 亨 准教授 (Northwestern University) 2019年5月31日（和光キャンパス）

ワークショップのお知らせ：第19回日本蛋白質科学会年会「細胞環境における蛋白質・蛋白質および蛋白質・核酸相互作用の計算機シミュレーション」2019年6月26日（神戸）（詳細はこちら）

理化学研究所一般公開のお知らせ：　2019年4月20日（土）（和光キャンパス）
（詳しくはこちら）

Jaewoon Jung 専任技師らによる超巨大系(GATA4)のシミュレーションに関する論文がJ. Comput. Chem.誌に掲載されました。

Weitong Ren 特別研究員が着任しました。

Marta Kulik 特別研究員が異動しました。

セミナーのお知らせ：Prof. Wonpil Im (Lehigh University) 2019年3月11日（和光キャンパス）

セミナーのお知らせ：Prof. Kenneth M. Merz, Jr. (Michigan State University) 2019年3月7日（和光キャンパス）

Hybrid QM/MM計算による非調和振動解析についての論文がJ. Chem. Theory Comput.誌に掲載されました。

Bo Thomsen 基礎科学特別研究員が異動しました。

George A. Pantelopulos 国際プログラム・アソシエイト が帰国しました。

セミナーのお知らせ：Prof. Daniel M. Zuckerman (Oregon Health & Science University) 2018年12月5日（和光キャンパス）

山田 健太 特別研究員が異動しました。

大きな時間ステップの使用を可能にするoptimal temperature evaluationについての論文がJ. Chem. Theory Comput.誌に掲載されました。

セミナーのお知らせ：Prof. John E. Straub (Boston University)、宮下 尚之 准教授（近畿大学）、岡本 祐幸 教授 （名古屋大学） 2018年11月12日（和光キャンパス）

セミナーのお知らせ：Dr. Robert Best (NIH) 2018年10月26日（和光キャンパス）

クライオ電顕のフィッティング高速化に関する論文がstructure誌に掲載されました。

Marta Kulik 特別研究員らの研究成果がNucleic Acids Research誌に掲載されました。

セミナーのお知らせ：Prof. Heather Kulik (Massachusetts Institute of Technology) 2018年8月06日（和光キャンパス）

George A. Pantelopulos 国際プログラム・アソシエイト が研究室に加わりました。

セミナーのお知らせ：Prof. Patrick Barth (Baylor College of Medicine) 2018年6月29日（和光キャンパス）

森 貴治 研究員が第18回日本蛋白質科学会年会にて「若手奨励賞」および「若手奨励賞優秀賞」を受賞しました！

gRESTの実装などを含むGENESIS 1.3.0を公開しました！
詳細はこちら

generalized REST (gREST)法に関する論文がJ. Chem. Phys.誌に掲載されました。

Markov State Modelのデータ同化に関する論文がeLife誌に掲載されました。

機械学習を用いたMarkov State Modelの改訂に関する論文がJ. Chem. Phys.誌に掲載されました。

multiple time step (MTS) integrationに関する論文がJ. Chem. Phys.誌に掲載されました。

APP C99の構造に関する論文がBiochim. Biophys. Acta誌に掲載されました。

理化学研究所一般公開のお知らせ：　2018年4月21日（土）（和光キャンパス）
詳しくはこちら

Hisham Dokainish 特別研究員が着任しました。

優 乙石 研究員、Donatas Surblys 特別研究員が異動しました。また湯淺 拓也研修生が卒業いたしました。

セミナーのお知らせ：Mr. Tomasz Pieńko and Prof. Joanna Trylska (University of Warsaw) 2018年03月09日（和光キャンパス）

セミナーのお知らせ：Dr. Karissa Sanbonmatsu (Los Alamos National Laboratory) 2018年02月28日（和光キャンパス）

八木 清 専任研究員らの研究成果がPhys. Chem. Chem. Phys.誌に掲載されました。

N-glycanの構造に関する論文がScientific Reports誌に掲載されました。

Po-Hung Wang 特別研究員が異動しました。またGeorge A. Pantelopulos 実習生 が帰国しました。

セミナーのお知らせ：苙口友隆　先生（慶應義塾大学）2017年12月25日（和光キャンパス）

セミナーのお知らせ：Kenneth M. Merz Jr教授（ミシガン州立大学）2017年11月29日（和光キャンパス）

分子混雑環境下における蛋白質の拡散について論じた論文がJ. Phys. Chem. B誌に掲載されました。

新津 藍 基礎科学特別研究員が第55回日本生物物理学会年会にて「若手奨励賞」を受賞しました！
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イリノイ大学シカゴ校のHuan-Xiang Zhou 教授がサバティカルビジターとして研究室に加わりました。（11/5まで滞在されました）

細胞内分子ダイナミクスに関する総説がMolecular Science誌（分子科学会会誌）に掲載されました。

George A. Pantelopulos 実習生 (JSPS fellow) が研究室に加わりました。

膜タンパク質のシミュレーションに関する総説が「医学のあゆみ」誌に掲載されました。

城生体金属科学研究室との共同研究成果が、Proc. Acad. Natl. Sci 誌に掲載されました。

GENESIS1.1の論文がJ. Comput. Chem.誌に掲載されました。

細胞内分子ダイナミクスに関する総説がJ. Phys. Chem. B誌に掲載されました。

新津 藍 基礎科学特別研究員が第17回日本蛋白質科学会年会にて「若手奨励賞」および「若手奨励賞優秀賞」を受賞しました！

Bo Thomsen基礎科学特別研究員らの研究成果がJ. Phys. Chem. B誌に掲載されました。

塚崎研究室(奈良先端大)との共同研究成果が、Cell. Rep. 誌に掲載されました。

細胞質の大規模MD シミュレーションに関する総説が、アンサンブル誌（分子シミュレーション研究会会誌）に掲載されました。

Raimondas Galvelis特別研究員らの研究成果がJ. Chem. Theory Comput.誌に掲載されました。

セミナーのお知らせ： Joanna Trylska教授（ワルシャワ大）2017年4月20日（和光キャンパス）

Raimondas Galvelis特別研究員らの研究成果がJ. Chem. Theory Comput.誌に掲載されました。

新津 藍基礎科学特別研究員が着任しました。

末安 允央研修生とRaimondas Galvelis特別研究員が異動しました。

八木 清研究員らの研究成果が、J. Phys. Chem. A 誌に掲載されました。

Po-Hung Wang特別研究員らの研究成果がChem. Phys. Lett.誌に掲載されました。