基礎科学特別研究員 辻村正樹

学歴
2025年 | 東京大学大学院 工学系研究科 先端学際工学専攻 博士課程 修了(博士(工学)) |
2022年 | 東京大学大学院 工学系研究科 応用化学専攻 修士課程 修了 |
2020年 | 東京大学 工学部 卒業 |
職歴
2025年4月 – 現在 | 基礎科学特別研究員(理化学研究所 杉田理論分子科学研究室) |
2022年4月 – 2025年3月 | 日本学術振興会 特別研究員(DC1) |
所属学会
- 日本生物物理学会
- 蛋白質科学会
- 分子科学会
研究テーマ
- Constant-pH MD法を用いた蛋白質内プロトン移動の解析
出版物
査読付き論文
- Stretching vibrational frequencies and pKa differences in H-bond networks of protein environments, Masaki Tsujimura, Keisuke Saito, and Hiroshi Ishikita, Biophys. J. 122, 4336–4347 (2023).
- Mechanism of absorption wavelength shift depending on the protonation state of the acrylate group in chlorophyll c, Masaki Tsujimura, Minaka Sugano, Hiroshi Ishikita, and Keisuke Saito, J. Phys. Chem. B 127, 505–513 (2023).
- Proton transfer and conformational changes along the hydrogen bond network in heliorhodopsin, Masaki Tsujimura, Yoshihiro Chiba, Keisuke Saito, and Hiroshi Ishikita, Commun. Biol. 5, 1336 (2022).
- Absorption wavelength along chromophore low-barrier hydrogen bonds, Masaki Tsujimura, Hiroyuki Tamura, Keisuke Saito, and Hiroshi Ishikita, iScience 25, 104247 (2022).
- Proton transfer pathway in anion channelrhodopsin-1, Masaki Tsujimura, Keiichi Kojima, Shiho Kawanishi, Yuki Sudo, and Hiroshi Ishikita, eLife 10, e72264 (2021).
- Identification of intermediate conformations in the photocycle of the light-driven sodium-pumping rhodopsin KR2, Masaki Tsujimura and Hiroshi Ishikita, J. Biol. Chem. 296, 100459 (2021).
- Mechanism of absorption wavelength shifts in anion channelrhodopsin-1 mutants, Masaki Tsujimura, Tomoyasu Noji, Keisuke Saito, Keiichi Kojima, Yuki Sudo, and Hiroshi Ishikita, BBA Bioenergetics 1862, 148349 (2021).
- Insights into the protein functions and absorption wavelengths of microbial rhodopsins, Masaki Tsujimura and Hiroshi Ishikita, J. Phys. Chem. B 124, 11819–11826 (2020).